Microbiote

Qu’est ce que le microbiote ?

Le microbiote représente l’ensemble des micro-organismes vivant dans un écosystème. Notre corps héberge 100 000 milliards de micro-organismes – essentiellement des bactéries – soit 10 fois plus que de cellules. On parle souvent du microbiote intestinal, mais nous possédons également un microbiote oro-pharyngé, cutané ou encore vaginal. Dans l’intestin, les micro-organismes sont majoritairement localisés dans l’intestin grêle et le côlon. Le microbiote est constitué par deux grands groupes de bactéries : les Firmicutes et les Bacteroidetes. Le microbiote est très complexe. Encore récemment, les chercheurs n’avaient qu’une vision très fragmentée de sa composition et de sa fonction. L’étude du microbiote intestinal a révélé des fonctions jusqu’alors insoupçonnées, notamment au niveau du fonctionnement cérébral.

Les recherches sur le microbiote montrent que le microbiote intestinal est propre à chaque individu : il est unique et se constitue très rapidement au cours de la période péri-natale. Notre flore intestinale joue un rôle direct dans la digestion, le fonctionnement du tube digestif et celui du système immunitaire intestinal. Il agit également à distance sur divers organes comme le cerveau, le coeur et les poumons. Des métabolites microbiens peuvent en effet diffuser dans le sang et ainsi gagner certains organes. La composition et l’activité métabolique du microbiote intestinal sont très liées à notre alimentation. Manger de façon variée et sans excès ne sera que profitable à notre microbiote, et donc à notre santé.

La recherche sur le microbiote intestinal est indispensable pour mieux comprendre son rôle dans certaines maladies, notamment les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI) comme la maladie de Crohn et la rectocolite hémorragique. Le microbiote est aussi très étudié dans les maladies cardiovasculaires (athérosclérose, hypertension), métaboliques (diabète, obésité) et les maladies inflammatoires pulmonaires comme l’asthme ou la bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO).

Les travaux de recherche sur le microbiote à l’Institut Pasteur de Lille

Les équipes de l’Institut Pasteur de Lille travaillent sur les liens entre le microbiote et les maladies infectieuses et inflammatoires. L’équipe du Dr François Trottein du Centre d’Infection et d’Immunité de Lille (INSERM U1019 – CNRS UMR9017 – Univ Lille) étudie l’influence des infections respiratoires virales (grippe, COVID-19) sur la composition et la fonction du microbiote intestinal. « Les perturbations liées à  l’infection participent à la sévérité de la maladie » nous explique le chercheur. « Par ailleurs, l’altération du microbiote intestinal observée chez les patients développant des comorbidités (obésité, diabète) ou chez les patients âgés pourrait être responsable d’une susceptibilité accrue face aux infections » poursuit-il. « Des stratégies existent pour corriger cette altération, comme les probiotiques ou les prébiotiques ». L’équipe tente actuellement d’exploiter les propriétés du microbiote intestinal pour renforcer les défenses contre les infections respiratoires et en diminuer la sévérité.

L’équipe du Dr Philippe Gosset, également au CIIL, s’intéresse elle au rôle du microbiote dans les pathologies inflammatoires pulmonaires en particulier dans la BPCO et la mucoviscidose. « Le développement de ces maladies se traduit par des altérations du microbiote à la fois digestif et pulmonaire qui participent à l’initiation et/ou à l’évolution de la pathologie » nous explique Philippe Gosset. « Ces altérations ont un impact négatif sur la survenue et les conséquences des infections respiratoires, très fréquentes chez ces patients. L’objectif est de comprendre le rôle de ces interactions environnement/microbiote dans l’évolution des patients pour ensuite pouvoir intervenir sur ces processus et limiter les conséquences des infections » complète le chercheur.

Dossiers

Les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI)