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Plateforme d’analyses Protéomiques et de Protéines modifiées (P3M)

Plateformes Lilloises en Biologie & Santé – PLBS – UMS 2014 – US 41

Plateforme d'analyses P3M

Présentation

La Plateforme d’analyse Protéomique et de Protéines Modifiés (P3M)  est un plateau technologique de l’Institut Pasteur de Lille, faisant partie de l’Unité Mixte de Services PLBS -UMS 2014 – US 41.

P3M propose une expertise s’étendant de l’identification des protéomes par nanoLC-MSMS et emploi des banques de données ou analyse de novo, à leur quantification avec ou sans marquage. L’équipement disponible permet également l’étude des modifications post-traductionnelles (PTM) de petites tailles avec ou sans enrichissement, ainsi que la caractérisation des événements de maturation des protéines.

L’analyse des PTM d’une protéine peut-être réalisée au niveau peptidique, mais aussi par analyse de la masse de la protéine entière par LC-MS.

P3M dispose également du savoir-faire en masse native pour l’analyse des interactions entre protéines, ligands ou acides nucléiques.

Actus

  • Janvier 2020 : Intégration de P3M à l’UMS PLBS.

  • Juin 2020 : Mise au point de la méthode de Thermal Profiling des protéines par quantification TMT.

  • Septembre 2020 : Arrivée d’AS Lacoste.

  • Janvier 2021 : Labélisation de collaboration entre P3M et PAGés (Plateforme d’Analyse des Glycoconjugués) par l’Infrastructure en Biologie Sante et Agronomie (GIS IBiSA).

Projets transversaux

  H2020-SC1-BHC. Acronyme : FAIR

JC Sirard, Centre d’Infection & d’Immunité de Lille : Flagellin Aerosol Therapy as an Immunomodulatory Adjunct to the Antibiotic Treatment of Drug-Resistant Bacterial Pneumonia

  Projet Glycoprotéomique

Collaboration avec PAGés pour le développement de la caractérisation  et la quantification des glycopeptides d’Ac.

Membres

Jean-Michel SALIOU
Ingénieur de recherche IPL, responsable d’équipe

Anne-Sophie LACOSTE
Ingénieur d’étude UL

Publications

Rivera-Millot A, Slupek S, Chatagnon J, Roy G, Saliou JM, Billon G, Alaimo V, Hot D, Salomé-Desnoulez S, Locht C, Antoine R, Jacob-Dubuisson F.
Streamlined copper defenses make Bordetella pertussis reliant on custom-made operon.
Commun Biol. 2021 Jan 8;4(1):46. doi: 10.1038/s42003-020-01580-2. PMID: 33420409.

Trzaska C, Amand S, Bailly C, Leroy C, Marchand V, Duvernois-Berthet E, Saliou JM, Benhabiles H, Werkmeister E, Chassat T, Guilbert R, Hannebique D, Mouray A, Copin MC, Moreau PA, Adriaenssens E, Kulozik A, Westhof E, Tulasne D, Motorin Y, Rebuffat S, Lejeune F.
2,6-Diaminopurine as a highly potent corrector of UGA nonsense mutations.
Nat Commun. 2020 Mar 20;11(1):1509. doi: 10.1038/s41467-020-15140-z. PMID: 32198346; PMCID: PMC7083880.

Nagnan-Le Meillour P, Descamps A, Le Danvic C, Grandmougin M, Saliou JM, Klopp C, Milhes M, Bompard C, Chesneau D, Poissenot K, Keller M.
Identification of potential chemosignals in the European water vole Arvicola terrestris.
Sci Rep. 2019 Dec 5;9(1):18378. doi: 10.1038/s41598-019-54935-z. PMID: 31804568; PMCID: PMC6895148.

Lesage KM, Huot L, Mouveaux T, Courjol F, Saliou JM, Gissot M.  
Cooperative binding of ApiAP2 transcription factors is crucial for the expression of virulence genes in Toxoplasma gondii.
Nucleic Acids Res. 2018 Jul 6;46(12):6057-6068. doi: 10.1093/nar/gky373. PMID: 29788176; PMCID: PMC6159514.

Montpellier C, Wychowski C, Sayed IM, Meunier JC, Saliou JM, Ankavay M, Bull A, Pillez A, Abravanel F, Helle F, Brochot E, Drobecq H, Farhat R, Aliouat-Denis CM, Haddad JG, Izopet J, Meuleman P, Goffard A, Dubuisson J, Cocquerel L.  
Hepatitis E Virus Lifecycle and Identification of 3 Forms of the ORF2 Capsid Protein.
Gastroenterology. 2018 Jan;154(1):211-223.e8. doi: 10.1053/j.gastro.2017.09.020. Epub 2017 Sep 25. PMID: 28958858.


Mots-clés

Protéomique ; Modification post-traductionnelle ;  Glycoprotéomique ; Masse native 

Contact équipe

Jean-Michel Saliou
Ingénieur de recherche, responsable d’équipe

jean-michel.saliou@pasteur-lille.fr
03 20 87 71 76