La tuberculose multirésistante aux antibiotiques représente un tiers de la mortalité due à la résistance aux antimicrobiens. Les tests diagnostiques standards nécessitent des cultures qui peuvent prendre plusieurs semaines, ou ne dépistent qu’un nombre réduit de mutations liées à la résistance. L’étude publiée dans le European Respiratory Journal décrit et évalue exhaustivement pour la première fois un nouveau test moléculaire, appelé Deeplex Myc-TB, directement applicable sur des échantillons cliniques sans culture, et capable de prédire la résistance à 13 classes de médicaments antituberculeux. Les résultats obtenus sur base d’analyse de plusieurs milliers de souches bactériennes et d’échantillons cliniques démontrent son haut degré de précision par rapport aux tests de référence. Ces données soutiennent l’utilisation à plus grande échelle de ce nouveau test, déjà exploité par l’OMS pour des études de surveillance de la tuberculose antibiorésistante. Ce test moléculaire a été développé par la société Genoscreen, implantée sur le campus de l’Institut Pasteur de Lille, avec la collaboration de l’équipe du Docteur Philippe Supply (Centre d’infection et d’Immunité de Lille).
Deep amplicon sequencing for culture-free prediction of susceptibility or resistance to 13 anti-tuberculous drugs.
Jouet A, Gaudin C, Badalato N, Alix-Béguec C, Duthoy S, Ferré A, Diels M, Laurent Y, Contreras S, Feuerriegel S, Niemann S, André E, Kaswa MK, Tagliani E, Cabibbe A, Mathys V, Cirillo D, de Jong BC, Rigouts L, Supply P.
Eur Respir J. 2020 Sep 17. pii: 2002338