Influenza, Immunité et Métabolisme
INSERM U1019 – CNRS UMR9017 – Université de Lille – CHU Lille – Institut Pasteur de Lille

Présentation
Les infections respiratoires virales et bactériennes représentent un lourd fardeau pour la société. L’âge et les comorbidités, telles que les pathologies métaboliques chroniques, sont les principaux facteurs de risque de morbi-mortalité due aux infections respiratoires. Notre laboratoire s’intéresse aux infections par le virus de la grippe et le pneumocoque et, plus récemment, par le coronavirus SARS-CoV-2, responsable de la pandémie de COVID-19. Nos objectifs sont (i) identifier les mécanismes de défense de l’hôte contre ces infections, (ii) définir les facteurs liés à l’âge et aux comorbidités associés aux formes sévères d’infection, et (iii) développer de nouvelles thérapies anti-infectieuses. Nous nous intéressons particulièrement au microbiote intestinal et au tissu adipeux, décrits comme régulant les réponses immunitaires lors des infections respiratoires. Une meilleure compréhension de l’axe intestin/poumon/tissu adipeux pourrait conduire à des découvertes exploitables d’un point de vue thérapeutique.
Actus
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Notre équipe possède une expertise reconnue dans le domaine des infections respiratoires et de l’immunité innée. Nous cherchons à comprendre les mécanismes responsables des dysfonctionnements immunitaires liés à l’âge et aux comorbidités, dont l’obésité. Nous nous intéressons aux infections virales (virus de la grippe, SARS-CoV-2) et bactériennes (pneumocoque) et au rôle du microbiote dans le contexte de l’axe intestin-poumon. Nous avons récemment identifié et breveté des procédés thérapeutiques contre l’infection par le virus grippal et le pneumocoque. Parmi ceux-ci, des facteurs dérivés du microbiote intestinal, tels que les acides gras à chaînes courtes (AGCC) ont conduit à des résultats prometteurs (ANR ACROBAT, Région Hauts-de-France). Ces métabolites atténuent la sévérité et les effets secondaires de la grippe, dont les surinfections bactériennes (Cell Reports 2020). Des approches pharmacologiques et l’utilisation de prébiotiques et de probiotiques sont à l’étude, notamment des souches bactériennes sélectionnées présentant de fortes propriétés anti-inflammatoires et capables de produire des AGCC en présence de fibres spécifiques.
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L’obésité, qui correspond à un excès de tissu adipeux blanc, est l’un des principaux facteurs de risque des formes graves d’infections respiratoires, questionnant sur le rôle du tissu adipeux dans la physiopathologie de ces infections. Nous avons récemment montré que l’infection grippale conduit à des perturbations chroniques du métabolisme de l’hôte ainsi qu’à des modifications des propriétés inflammatoires et métaboliques du tissu adipeux blanc, caractérisées notamment par le brunissement du tissu (Commun Biol 2020). Les mécanismes d’induction du brunissement du tissu adipeux sont en cours d’étude, à la fois chez des souris jeunes adultes et des souris âgées (CPER CTRL 19 FEDER DESTRESS-Flu).
Projet transversal
Conséquences de la dérégulation du rythme circadien lié à l’âge sur les défenses immunitaires contre les infections respiratoires
Nous étudions l’influence de l’âge sur les infections respiratoires. Nous nous intéressons notamment au lien entre sénescence cellulaire et infections respiratoires (ANR INFLUENZAGEING et SENOCOVID). Nos résultats chez la souris mettent également en lumière le lien entre le dysfonctionnement du rythme circadien et l’altération des mécanismes de défense au niveau pulmonaire (en lien avec Inserm U1011, H Duez/B Pourcet). Nous pensons que l’expression non contrôlée de certains gènes de l’horloge perturbe l’efficacité de la réponse immunitaire innée, favorisant ainsi l’infection (CPER CTRL 19 FEDER et ANR DREAM).
Membres
François TROTTEIN
DR1 CNRS, responsable de l’équipe I2M
Numéro ORCID : 0000-0003-3373-1814
Corinne GRANGETTE
DR Institut Pasteur de Lille, responsable de l’axe pro et prébiotes
Numéro ORCID : 0000-0003-2398-44
Isabelle WOLOWCZUK
DR2 CNRS, responsable de l’axe comorbidité
Numéro ORCID : 0000-0001-6692-6904
Lucie DERUYTER
Technicienne, Université de Lille
Séverine HEUMEL
Technicienne, Institut Pasteur de Lille
Cyril ROBIL
Ingénieur d’étude, Institut Pasteur de Lille (CDD)
Loïc CHOLLET
Ingénieur d’étude, Institut Pasteur de Lille (CDD)
Fabiola SILVA ANGULO
Post-doctorant (Institut Pasteur de Lille)
Lou DELVAL
Thèse (Université de Lille)
Johanna BARTHELEMY
Thèse (Université de Lille)
Ozmen ÇOBANOGLU
Thèse (bourse Marie Sklodowska-Curie)
Emma BOGARD
Thèse (Université de Lille)
Publications
Paget C, Deng S, Soulard D, Priestman DA, Speca S, von Gerichten J, Speak AO, Mallevaey, T, Pewzner-Jung Y, Futerman AH, Faveeuw C, Platt FM., Sandhoff R and Trottein F (2019).
Mammalian ganglioside species with specific ceramide backbones activate invariant Natural Killer T cells.
Plos Biology 17(3):e3000169.
Sencio V, Barthelemy A,Tavares LP, Gomes Machado M, Soulard D, Cuinat C, Noordine ML, Salomé Desnoulez S, Deryuter L, Foligné B, Wahl C, Thomaz Viera A, Paget C, Milligan G, Ulven T, Wolowczuk I, Faveeuw C, Le Goffic R, Thomas M, Ferreira S, Mauro M Teixeira MM and Trottein F (2020).
Gut dysbiosis during influenza contributes to pulmonary pneumococcal superinfection through altered short-chain fatty acid production.
Cell Reports. 30(9):2934.
Ayari A, Rosa-Calatrava M, Lancel S, Barthelemy J, Pizzorno A, Mayeuf-Louchart A, Baron M, Hot D, Deruyter L, Soulard D, Faveeuw C, Sencio V, Le Goffic R, Trottein F and Wolowczuk I (2020).
Influenza A virus infection rewires energy metabolism and induces browning features in adipose cells and tissues.
Communications Biology 4;3(1):237
Sokol H, Contreras V, Maisonnasse P, Desmons A, Delache B, Sencio V, Machelart A, Brisebarre A, Humbert L, Deryuter L, Heumel S, Dereuddre-Bosquet N, Menu E, Ho Tsong Fang R, Lamaziere A, Brot L, Wahl C, Oeuvray C, van der Werf S, Ferreira S, Le grand R and Trottein F (2020).
SARS-CoV-2 infection in nonhuman primates alters the composition and functional activity of the gut microbiota.
Gut Microbes 3(1):1-19
Sencio V, Machelart A, Robil C, Benech N, Hoffmann E, Galbert C, Deryuter L, Heumel H, Hantute-Ghesquier A, Flourens A, Brodin P, Infanti F, Richard V, Dubuisson J, Grangette C, Sulpice T, Wolowczuk I, Pinet F, Prévot V, Belouzard S, Briand F, Duterque-Coquillaud M, Sokol H and Trottein F (2022).
Alteration of the gut microbiota following SARS-CoV-2 infection correlates with disease severity in hamsters.
Gut Microbes 14(1):2018900
Mots-clés
Contact équipe
François Trottein
Responsable de l’équipe Influenza, Immunité & Métabolisme
françois.trottein@pasteur-lille.fr
03 20 87 78 85