Des chercheurs de l’Institut Pasteur de Lille (U1167, CNRS ERL9002, Inserm U1177, Centre d’Infection et d’Immunité de Lille, Univ Lille) ont pour la première fois analysé par spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN) la protéase principale du SARS-CoV-2, l’agent de la COVID-19. Cette protéase au nom de code « 3CLpro » est une cible thérapeutique prometteuse. Elle est très spécifique des coronavirus et elle n’est pas présente chez l’homme. Les chercheurs ont obtenu des informations structurales et dynamiques, à l’échelle atomique, de cette enzyme dont le mode d’action est extrêmement complexe.
Ces résultats sont importants pour le développement futur de médicaments antiviraux. Les chercheurs ont donc réalisé un criblage de fragments moléculaires par RMN contre la protéase 3CLpro. Plusieurs candidats capables d’inactiver l’activité enzymatique ont été identifiés. L’un d’entre eux inhibe la réplication du virus dans les cellules. Les chercheurs tentent maintenant d’optimiser l’efficacité de ces inhibiteurs pour proposer des candidats médicaments visant la vaste famille des coronavirus et pas seulement SARS-CoV2.
Ce travail, fruit d’un vaste programme collaboratif et multidisciplinaire lillois, est publié dans la prestigieuse revue Angew Chem Int Ed Engl.

NMR spectroscopy of the main protease of SARS-CoV-2 and fragment-based screening identify three protein hotspots and an antiviral fragment.
Cantrelle FX, Boll E, Brier L, Moschidi D, Belouzard S, Landry V, Leroux F, Dewitte F, Landrieu I, Dubuisson J, Deprez B, Charton J, Hanoulle X.
Angew Chem Int Ed Engl. 2021 Sep 27. doi: 10.1002/anie.202109965.