Divers outils ont été développés pour étudier l’organisation spatiale du microbiote intestinal ; la plupart étant basés sur l’immunofluorescence ou l’hybridation in situ. Le groupe de Catherine Daniel (Centre d’Infection et d’Immunité de Lille) a développé une nouvelle approche d’imagerie pour étudier la persistance de Lactobacillus plantarum, un probiotique bénéfique pour l’organisme. L’équipe a combiné une technique d’imagerie non invasive du corps entier avec de la microscopie confocale à fluorescence pour évaluer l’impact de l’inflammation intestinale sur la persistance de cette bactérie. Des projections 3D orthogonales montrent une localisation différente de L. plantarum selon l’état inflammatoire de l’intestin. Ce travail pourrait permettre de mieux comprendre les modalités d’interaction entre les bactéries intestinales et l’organisme ce qui pourrait conduire à des perspectives intéressantes dans la lutte contre les maladies inflammatoires du tube digestif.
Persistence and dynamics of fluorescent Lactobacillus plantarum in the healthy versus inflamed gut.
Salomé-Desnoulez S, Poiret S, Foligné B, Muharram G, Peucelle V, Lafont F and Daniel C.
Gut Microbes 2021 Vol 13 (1) : 1-16; doi : 10.1080/19490976.2021.1897374